Cette mission s'organise à partir d'établissements et de services médico sociaux permettant l'hébergement, l'accompagnement ou la prise en charge dans un triple objectif éducatif, pédagogique et thérapeutique.
L'Association propose des parcours individualisés prenant en compte les besoins des personnes accueillies et de leurs familles et les Recommandations de Bonnes Pratiques Professionnelles.
Cette mission concerne également l'insertion professionnelle de personnes handicapées à travers une Entreprise Adaptée et un ESAT.
Mobilisés en faveur d’une « réponse accompagnée pour tous », les établissements et services concourant à cette mission représentent près de 770 places d'accueil sur l'ensemble du territoire.
Fortement impliquée dans le champ de l'autisme depuis de nombreuses années, l'AHS-FC propose un accompagnement spécialisé au sein de plusieurs dispositifs dédiés (classes maternelles, primaire, collège ; places d’internat).
Par ailleurs, l’AHS-FC anime dans le Doubs deux supports départementaux enfants et adultes :